利用SSR标记分析蔗茅种质资源遗传多样性.doc

摘要:蔗茅（Erianthus rufipilus）是禾本科(Gramineae)、甘蔗亚族(Saccharinae)、蔗茅属(Erianthus)的一个野生种,原产于热带、亚热带和温带。具有抗旱、抗寒、耐贫瘠，锤度高等优良性状，在甘蔗育种中极具利用价值。本研究采用SSR标记技术对蔗茅进行遗传多样性分析，从22对引物中筛选出对蔗茅遗传多样性高的13对引物；13对引物共扩增出311条带，其中多态性条带311条，多态性比例为100%；48份蔗茅资源的遗传相似性范围在遗传相似性系数在0.5032～0.9806之间，平均为0.8147。通过UPGMA法，在相似性系数为0.6631处，可将54份材料划分为三大类群。A类群包含2份斑茅材料；B类群包含2份割手密材料；C类群包含滇蔗茅和蔗茅50份材料，在相似性系数为0.7608处分割，又可将C类群划分为2个亚群，C1类群数量较少，由2分滇蔗茅构成，C2类群数量最多，由48份蔗茅材料构成。在C2类群数，在相似性系数为0.8809处分割，可将蔗茅群体分为7个不同的类群，其中蔗茅21单独为一个类群， 来源于贵州的蔗茅38和蔗茅44为一个类群。表明蔗茅具有较丰富的遗传多样性，聚类结果与地理分布没有明显的关系。本研究结果较全面反映了中国保存的蔗茅种质资源遗传多样性的特点，为我国蔗茅资源进一步考察收集和引进，以及优异蔗茅基因资源挖掘和育种利用提供了理论依据。

关键词：蔗茅；SSR；遗传多样性

目录

摘要

Abstract

1.前言-1

1.1 甘蔗种质资源概念-1

1.2 甘蔗种质资源遗传多样性研究进展-1

1.3 蔗茅种质资源研究进展-4

2.材料与方法-6

2.1 材料、试剂及主要仪器-6

2.2 实验方法-7

3.结果与分析-11

3.1 总DNA的提取与质量检测-11

3.2 引物筛选-11

3.3 遗传相似性分析-11

3.4 聚类分析-12

3.5 主成份分析-12

4.讨论-15

4.1 SSR引物筛选-15

4.2 SSR电泳与银染-15

4.3 SSR分子标记技术-15

5.结论-17

参考文献-18

致谢-23