基于SSR标记的沙棘种质指纹图谱的构建.docx

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  • 更新时间:2019-05-09
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  • 课题出处:(桑桑老师)提供原创资料
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摘要:沙棘是经济和生态价值双优的灌木或小乔木树种,已经在食品、化妆品、医药、生态保护等领域得到广泛的应用。然而,不同种质(品种)间遗传关系仍然不清晰,导致育种中亲本的选择是一个棘手的问题,阻碍了沙棘的遗传育种进程。本研究以8份沙棘种质为研究材料,开发适用于沙棘的SSR引物,然后利用开发的SSR引物对不同沙棘种质进行PCR扩增,将扩增产物进行8%聚丙烯酰胺凝胶电泳,然后根据电泳图谱进行SSR多态性分析及分子指纹图谱构建。结果显示:筛选出可用引物12对,对8个品种共扩增出31条带,其中多态性16条,PIC在0-0.5之间,平均值为0.2333,遗传相似性系数在0.816-0.909之间。8个品种在遗传相似系数为0.80处分为两大类,一类以CX和SQH分为一个单组,表明与其他六个品种亲缘关系较远。同时,筛选出4对核心SSR引物,构建出可区分8份沙棘种质的核心指纹图谱。这些结果将为沙棘的遗传育种工作奠定基础。

 

关键词:沙棘;分子标记;SSR;指纹图谱;PCR

 

目录

摘要

Abstract

1 引言-1

1.1 沙棘的生物学特性-1

1.2沙棘的经济价值-1

1.3沙棘的生态价值-1

1.4分子标记简介及其在沙棘中的应用-2

1.4.1 分子标记-2

1.4.2 分子标记在沙棘中的应用-3

1.5本研究的目的及意义-3

2实验材料与方法-4

2.1实验材料-4

2.2实验试剂-4

2.3 实验器材-5

2.4 实验方法-6

2.4.1沙棘总DNA的提取-6

2.4.2  PCR扩增及退火温度的优化-7

2.4.3 聚丙烯酰胺凝胶电泳-7

3实验结果-9

3.1 DNA提取质量-9

3.2 SSR标记引物的筛选结果-10

3.3 SSR多态性分析及核心指纹图谱构建-12

3.4 聚类分析-14

4讨论-15

参考文献-16

致谢-18


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