人MUC16蛋白理化性质的生物信息学分析.rar

摘要：目的 用生物信息学软件分析人类细胞表面粘液蛋白（Homo sapiens mucin 16, MUC16)蛋白的理化性质，获取该基因的相关因素。方法 利用DNAstar、ScanProsite、Protparam、ProtScale软件预测和分析MUC16蛋白的理化性质和其他特殊局部结构分析。结果 推测MUC16基因编码蛋白分子式为：C132887H221960N43816O53721S13577，理论等电点5.1；有5个蛋白活性位点。并含有α螺旋103个，β折叠105 个，溴化氰（Cyanogen bromide, CNBr）的酶切位点有358个，胰凝乳蛋白酶(Chymotrypsin)的酶切位点有2342个。总的亲水性平均系数 (Grand average of hydropathicity, GRAVY) 为1.027。MUC16蛋白是一个亲水、不稳定的蛋白。

关键词：MUC16；理化性质；生物信息学

Abstract：Objective To obtain information of the human MUC16 protein in the physical and chemical properties, the character of this gene and its product protein were analyzed by a series of bioinformatics software. Methods The physical and chemical properties and the other special structural analysis of the human MUC16 were analyzed by the DNAstar、ScanProsite、Protparam、ProtScale software. Results Theoretical pI of this protein was 5.1, and the formula was C132887H221960N43816O53721S13577. This protein contained five active sites. The results also showed that the protein had 103α - helix, 105β-fold, 358 cuts by CNBr and 2342 cuts by Chymotrypsin. The Grand average of hydropathicity (GRAVY) was 1.027. It was a hydrophilic and unstable protein.

Key words：MUC16; the physical and chemical properties; Bioinformatic

　　　生物信息学的另一个挑战是从蛋白质的氨基酸序列预测蛋白质结构。这个难题已困扰理论生物学家达半个多世纪，如今找到问题答案要求正变得日益迫切。诺贝尔奖获得者W. Gilbert在1991年曾经指出：“传统生物学解决问题的方式是实验的。现在，基于全部基因都将知晓，并以电子可操作的方式驻留在数据库中，新的生物学研究模式的出发点应是理论的。一个科学家将从理论推测出发，然后再回到实验中去，追踪或验证这些理论假设”。 

　　　生物信息学的主要研究方向： 基因组学 - 蛋白质组学 - 系统生物学 - 比较基因组学，1989年在美国举办生物化学系统论与生物数学的计算机模型国际会议，生物信息学发展到了计算生物学、计算系统生物学的时代。